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技术贴五: 如何选择适合你的成像系统:相机技术综合贴

人阅读 发布时间:2019-12-09 12:56

在前四期的技术贴中,我们学习了科研级相机的几个重要参数,今天我们来对它们做一个总结。
 

1. 数码相机成像原理

 

温故而知新,我们回顾一下数码相机的成像原理:

(图一:数码相机成像原理

 

如图一所示,在WB实验中,镜头收集样品自发光并将其聚焦于感光芯片上,感光芯片将接收到的光信号(光子)转换成电子,电子通过模数转换器(ADC)按照一定的转换系数转换成数字信号,这个转换系数我们称之为增益(Gain),转换成的数字信号我们称之为灰度值(Gray Scale)。最后通过软件的处理,图像可被输出为各种格式的电子文件(如:JPG, Tiff,Png等)。

 

2.量子效率(QE)

量子效率(Quantum Efficiency,简称:QE)指的是感光芯片将光子转化为电子的效率(点击此处查看原文)。量子效率是衡量相机灵敏度的重要指标,因为灵敏度是指相机采集真实的信号的能力,它可以用电子数来量化:

 

电子数=(灰度值–偏置) X 增益

通过相机的工作原理我们了解到,量子效率与电子数和灰度值均成正比。一款相机的QE越高,其灵敏度也越强。




3.信噪比SNR


信噪比(SIGNAL-NOISE RATIO,简称:SNR)是指在成像过程中信号与噪声的比值(点击此处查看原文)。

信噪比作为成像系统的一个重要指标与以下几点有关:

 

a. 信号强度

在相机本身的量子效率不变的前提下,我们可通过增强样品信号或延长曝光时间来收集更多信号,即光子。信号越强,信噪比越好。

 

b. 散粒噪声

噪声本身也是一种信号。散粒噪声作为无法避免但影响最大的噪声,伴随着信号的加强而增大。由于散粒噪声无法避免,对比相机信噪比主要比较的是读出噪声和暗电流噪声。信噪比公式可简化为:

 

c. 读出噪声

读出噪声是相机在读出信号时产生的噪声,低的读出噪声有利于检测非常微弱的信号。

d. 暗电流噪声

尽管延长曝光时间可以增强信号,但是暗电流噪声会随着曝光时间而累积,因此在需要长时间曝光的实验(如WB实验)中,暗电流会产生较大的影响。CCD制冷是降低暗电流的手段之一,但我们真正应该关心的并非CCD的制冷温度而是暗电流的大小。

 

    此外,我们还学习了如何使用Image J对图像的信噪比进行计算(点击此处查看原文)。



4.分辨率和像素合并
 
相机的分辨率(Resolution)是指感光芯片上像素点的数量。芯片上的像素点越多,分辨率就越高,图片则更为细致(点击此处查看原文)。

 

在化学发光的应用中,是不是相机的分辨率越高就越好?这取决于我们的应用场景。如果我们要将wb的实验结果印刷在海报上,那么我们需要高分辨率的大图确保条带的边缘不会虚化。但是如果我们投递文献或者验证一下实验结果,那我们可以牺牲高分辨率选择使用像素合并(Binning)功能提高相机灵敏度,提高信噪比并快速获得实验结果。
 

像素合并(Binning)是指将相邻的像素所感应的电子合并在一起,以一个像素的模式读出,使用 Binning 模式会产生以下几点效应:

a. 相机灵敏度的提升;
b. 图像信噪比的增加;
c. 图像分辨率的下降。


总结一下

为化学发光成像系统选择适合的相机,我们需要综合以下几方面考虑:

1. 量子效率越大,相机越灵敏,相同的曝光时间下所能采集到的信号越强,从而更适合捕捉微弱的条带信号;

2. 噪声分为散粒噪声、读出噪声和暗电流噪声。由于散粒噪声无法避免,因此我们会选择读出噪声和暗电流都很低的相机。尤其因为化学发光成像需要长时间曝光,所以暗电流是我们着重考虑的因素;

3. 分辨率越高意味着图像更细节,然而在化学发光成像的应用中,分辨率的大小取决于我们的应用场景,如果是投递文献或者验证一下实验结果,我们可以牺牲高分辨率选择使用像素合并(Binning)功能提高相机灵敏度,提高信噪比并快速获得实验结果。


举个例子
 
上海勤翔化学发光成像系统目前所采用的原装进口科研级制冷相机,其量子效率可达75%,读出噪声在3e-5e,暗电流在制冷温度到达零下20℃时最低可达0.0001e/pixel/second,即使曝光时间长达30min,其产生的暗电流最低为(0.0001e*1800sec)=0.18e,远低于信号本身,可在长时间曝光的应用下保证信噪比。相机分辨率为605万像素,提供1x1,2x2,4x4等多种Binning模式,可满足用户在不同应用场景下样品拍摄的需求。

 
 
 

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